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非接觸DNA打斷儀|全基因組DNA樣品的超聲打斷
2025-03-05 10:04:43 來源:上海凈信實業(yè)發(fā)展有限公司 實驗目的:對全基因組DNA樣品進行100-500bp區(qū)間的片段化處理
實驗設(shè)備:非接觸DNA打斷儀XM-M220(單槽)基因組DNA樣品超聲打斷的實驗步驟:
1.提前15分鐘將三款儀器的冷水機啟動,設(shè)置溫度為4℃。
2.將每個0.2mL EP管加入130μL濃度為12ng/μL的全基因組DNA溶液。
3.將2管裝好樣品的0.2mL EP管分別放入儀器的適配器當中,其他空余的孔位由加同樣體積水的0.2mL EP管補齊。
4.程序設(shè)置:溫度4℃,超聲工作時間20s 間隔時間10s,總時長分別為3分鐘和4分鐘。
5.程序結(jié)束后,取出樣品使用毛細管電泳進行基因組片段化檢測。
打斷完的毛細管電泳檢測結(jié)果圖:1.程序設(shè)置:溫度4℃,超聲工作時間20s 間隔10s,總時長4分鐘
2.平均片段大小:266 bp,99-503 bp區(qū)間占比 89.33%。
實驗注意事項:
1.提前15分鐘將三款儀器的冷水機啟動,設(shè)置溫度為4℃
2.試用TPX材質(zhì)的EP管,管子的材質(zhì)影響超聲打斷效果。
3.客戶在做實驗時一定要讓跟隨著老師一起做實驗,不然后續(xù)結(jié)果不理想無法分析出原因。
非接觸超聲波DNA打斷儀采用等溫、旋轉(zhuǎn)離心管及非接觸的方式對樣品進行打斷勻漿和混合。通過球面固態(tài)超聲換能器將聲波以三維方式聚焦到樣本區(qū)域,聚焦聲波能夠以不同角度的能量輸入獲得良好的處理效果。
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